Deux nouveaux gènes candidats identifiés chez des adultes de la population de Terre-Neuve ayant une tendance à créer une dépendance à l'alimentation (2017)

Appétit. 2017 Jan 20. pii: S0195-6663 (17) 30024-7. doi: 10.1016 / j.appet.2017.01.004.

Pedram P1, Zhai G2, Gulliver W3, Zhang H4, Soleil G5.

Abstract

La dépendance alimentaire (AF) est une caractéristique clinique distinguée qui touche environ 5% des adultes de la population générale au Canada. L'AF contribue à l'obésité, cependant, les gènes sous-jacents de l'AF sont largement inconnus. Le but de la présente étude était de rechercher des gènes candidats FA à l'aide d'un séquençage d'exome suivi d'une étude de vérification utilisant les gènes identifiés les plus significativement associés. Sur un total de 752 adultes, 24 sujets ont été sélectionnés dont 8 obèses avec un score élevé et 8 obèses avec un score de symptôme clinique FA faible / nul (FAO, NFO) et 8 témoins sains avec un IMC normal et un score de symptôme FA faible / nul (Ctrl) . Le séquençage de l'exome a été effectué dans les trois groupes. Les 100 meilleurs SNP identifiés ont été classés en 5 sous-groupes en fonction des fonctions génétiques: addiction (Ad), troubles psychologiques, métabolisme énergétique et obésité, cancer, fonction inconnue ou avec d'autres maladies. Dans l'étude de vérification, les 19 principaux SNP du sous-groupe Addiction ont été génotypés chez l'ensemble des 752 sujets à l'aide de la technologie de génotypage Sequenom iPLEX Gold. La comparaison de NFO avec Ctrl et FAO avec NFO, Ctrl et le groupe combiné de NFO + Ctrl a révélé 19 SNP associés aux gènes Ad, notamment TIRAP, MMADHC, ERAP1, NTM, MYPN, GRID1, ITPR2, GPSM1, ZCCHC14, TNN, PPARD , CACNA1C, SIM1 et DRD2. Une analyse des associations génétiques a été réalisée. L'allèle majeur A de rs2511521 localisé dans DRD2 (OR = 3.1 (IC à 95% 1.1-8.2)) et l'allèle mineur T de rs625413 localisé dans TIRAP (OR = 2.5 (IC à 95% 1.1-5.8)) chez les sujets NFO significativement associés avec un risque accru de dépendance alimentaire. En utilisant une combinaison de méthode de séquençage d'exome et d'une approche d'association de gène candidat, deux nouveaux gènes candidats FA sont identifiés. Une étude plus approfondie sur le reste des gènes dans les quatre autres catégories sera justifiée.

MOTS-CLÉS: Analyse d'association de gènes candidats; Séquençage de l'exome; Dépendance alimentaire; La génétique

PMID: 28115213

DOI: 10.1016 / j.appet.2017.01.004