Divi jauni kandidāti gēni, kas identificēti pieaugušajiem no Ņūfaundlendas populācijas ar atkarību izraisošām tendencēm uz pārtiku (2017)

Apetīte. 2017 Jan 20. pii: S0195-6663 (17) 30024-7. doi: 10.1016 / j.appet.2017.01.004.

Pedram P1, Zhai G2, Gulliver W3, Zhang H4, Saule G5.

Anotācija

Pārtikas atkarība (FA) ir atšķirīga klīniskā pazīme, kas ietekmē apmēram 5% pieaugušo no vispārējās Kanādas populācijas. FA veicina aptaukošanos, tomēr FA pamatā esošie gēni lielākoties nav zināmi. Pašreizējā pētījuma mērķis bija meklēt FA kandidātgēnus, izmantojot eksomu secību, kam sekoja verifikācijas pētījums, izmantojot visnozīmīgāk saistītos identificētos gēnus. No 752 pieaugušajiem tika izvēlēti 24 subjekti, tostarp 8 aptaukošanās ar augstu un 8 aptaukošanās ar zemu / nulles FA klīnisko simptomu punktu skaitu (FAO, NFO) un 8 veselīgas kontroles ar normālu ĶMI un zemu / nulle FA simptomu rādītāju (Ctrl) . Exome sekvencēšana tika pabeigta visās trīs grupās. 100 labākie identificētie SNP tika iedalīti 5 apakšgrupās, pamatojoties uz gēnu funkcijām: atkarība (Ad), psiholoģiski traucējumi, enerģijas vielmaiņa un aptaukošanās, kā arī vēzis, nezināmas funkcijas vai citas slimības. Pārbaudes pētījumā top 19 SNP atkarības apakšgrupā tika genotipēti visos 752 priekšmetos, izmantojot Sequenom iPLEX Gold genotipēšanas tehnoloģiju. Salīdzinot NFO ar Ctrl un FAO ar NFO, Ctrl un apvienoto NFO + Ctrl grupu, tika atklāti 19 SNP, kas saistīti ar Ad gēniem, tostarp TIRAP, MMADHC, ERAP1, NTM, MYPN, GRID1, ITPR2, GPSM1, ZCCHC14, TNN, PPARD , CACNA1C, SIM1 un DRD2. Tika veikta ģenētiskās asociācijas analīze. Rs2511521 galvenā alēle A, kas atrodas DRD2 (OR = 3.1 (95% TI 1.1-8.2)), un RS625413 mazākā alēle T, kas atrodas TIRAP (OR = 2.5 (95% TI 1.1-5.8)) NFO priekšmetos, kas ir ievērojami saistīti ar paaugstinātu pārtikas atkarības risku. Izmantojot eksoma sekvencēšanas metodes un kandidāta gēnu asociācijas pieejas kombināciju, tiek identificēti divi jauni FA kandidātgēni. Būs pamatoti turpināt pētīt pārējos gēnus pārējās četrās kategorijās.

Atslēgas vārdi: Kandidātu gēnu asociācijas analīze; Exome secības noteikšana; Pārtikas atkarība; Ģenētika

PMID: 28115213

DOI: 10.1016 / j.appet.2017.01.004