To nye kandidatgener identifisert hos voksne fra Newfoundland-befolkningen med vanedannende tendenser mot mat (2017)

Appetitt. 2017 Jan 20. pii: S0195-6663 (17) 30024-7. doi: 10.1016 / j.appet.2017.01.004.

Pedram P1, Zhai G2, Gulliver W3, Zhang H4, Sun G5.

Abstrakt

Matavhengighet (FA) er et fremtredende klinisk trekk som rammer omtrent 5% voksne av befolkningen i Canada. FA bidrar til fedme, men de underliggende gener i FA er stort sett ukjente. Målet med den nåværende studien var å søke etter FA-kandidatgener ved hjelp av en exome-sekvensering etterfulgt av en verifikasjonsstudie med de mest signifikant assosierte identifiserte gener. Fra totalt 752 voksne ble 24 personer valgt inkludert 8 overvektige med høye og 8 overvektige med lav / null FA klinisk symptom score (FAO, NFO), og 8 sunne kontroller med normal BMI og lav / null FA symptom score (Ctrl) . Exome-sekvensering ble fullført i alle tre gruppene. De 100 beste SNPene som ble identifisert, ble kategorisert i 5 undergrupper basert på genfunksjoner: avhengighet (Ad), psykologiske lidelser, energimetabolisme og fedme, og kreft, ukjent funksjon eller med andre sykdommer. I verifiseringsstudien ble de 19 beste SNP-ene i Addiction-undergruppen genotypet i alle 752 forsøkspersoner ved bruk av Sequenom iPLEX Gold genotypeteknologi. Sammenligning av NFO med Ctrl og FAO med NFO, Ctrl og den kombinerte gruppen av NFO + Ctrl avslørte 19 SNPer assosiert med Ad-gener, inkludert, TIRAP, MMADHC, ERAP1, NTM, MYPN, GRID1, ITPR2, GPSM1, ZCCHC14, TNN, PPARD , CACNA1C, SIM1 og DRD2. Genetisk assosiasjonsanalyse ble utført. Den største allelen A av rs2511521 lokalisert i DRD2 (OR = 3.1 (95% KI 1.1-8.2)) og den mindre allelen T av rs625413 lokalisert i TIRAP (OR = 2.5 (95% KI 1.1-5.8)) hos NFO-forsøkspersoner med økt risiko for matavhengighet. Ved hjelp av en kombinasjon av exome-sekvenseringsmetode og en kandidatgenforeningstilnærming identifiseres to nye FA-kandidatgener. Videre studier av resten av genene i de andre fire kategoriene vil være berettiget.

Nøkkelord: Kandidatgenforening analyse; Exome sekvensering; Matavhengighet; genetikk

PMID: 28115213

DOI: 10.1016 / j.appet.2017.01.004